日軍在占據了203高地之後，就開始將從美國購入的280毫米炮轉移到高地上來，這樣這些巨炮就可以覆蓋整個的旅順市區和港口，俄軍所有的的目標就都直接暴露在日本人的炮口下了。
在第一輪突襲中損壞了的幾條戰艦，俄國人費盡了力氣總算勉強修好了，如果他們的動作能夠快一些的話，比如修復的時間能夠提前一兩個月，那麼這支艦隊還有機會在炮台的掩護下，駛出港口，和日本艦隊來個決一死戰。雖然旅順分艦隊的實力不如聯合艦隊，這一戰肯定凶多吉少。但是，聯合艦隊也不可能毫無損失。而這個時候，波羅的海艦隊已經開始了他們的史詩般的遠征，如果聯合艦隊在和旅順分艦隊的戰鬥中損失過多，那他們在面對趕來的波羅的海艦隊的時候，還有多少戰鬥力就會很成問題。然而，如今的情況完全不同了，就在俄國艦隊努力的修復船隻的時候，日本艦隊發起了針對旅順港的航道的堵塞行動。
日軍不斷的派出裝滿了石頭的老舊船隻，將它們開到旅順港出港的航道上沉沒掉，以此來封鎖旅順港的航道。當然，俄軍的炮台也不是吃素的，自然會開火攔截。而且相比艦炮，炮台上的大炮的射擊精度要高得多（軍艦會搖動，但炮台不會，而且炮台對於射界內的任何一個目**標區域都進行過試射，所以一開火就可以直接是效力射，不需要試射調整。）所以，很多的執行這種任務的船隻還沒行駛到位置，就被炮台擊沉了。不過日本海軍發揮了不怕傷亡的豬突精神，組織了一次又一次的船隊，頂著巨大的傷亡，最終還是在旅順分艦隊恢復航海能力之前，用沉船將航道堵了個嚴嚴實實。所以，如今的旅順分艦隊，已經是瓮中之鱉，無處可逃了。以至於俄國人只能將軍艦上的大炮拆下來，搬上岸當做岸炮使用了。
將280毫米巨炮拉上203高地不是一件容易的事。這種炮實在是太重了，必須先鋪上鐵軌，然後利用蒸汽機、絞盤，才能慢慢的將這東西拖上去。這一來一去的竟然花費了一個多月的時間。等到日本人總算把手裡的十多門280毫米炮都拖到203高地的炮位，才開了幾炮，俄國人就派出了軍使，提出要向日軍投降。
旅順的俄國人一投降，那些化學武器是怎麼來了的秘密當然立刻就讓日本人知道了。他們自然也知道，自己花了大價錢買回來的防毒面具什麼的其實一點用都沒有，因為俄國人根本就沒有化學武器。這一切完全就是美國佬做好了的圈套。
然而雖然吃了這樣的虧，但是日本政府卻發現，他們完全沒有反擊的辦法。如今雖然旅順港已經被攻占了，但是俄軍還沒有完全失敗。如果這時候和美國人翻臉，只怕美國人立刻就會又和俄國人勾結起來，然後會發生什麼事情，那就真的難說了。別的不說，就比方說防毒面具吧，如今訂購的防毒面具還沒有完全交貨，但是日本政府雖然已經明知道俄國人沒有化學武器了，卻還是不敢提出終止合同或者退貨。原因很簡單，因為一旦提出這樣的要求，恐怕俄國就會突然變戲法一樣的有了化學武器。
就這樣，在戰局的壓迫下，雖然明知道被美國佬擺了一道，但是日本政府也只能打落牙齒和血吞，暫時裝作什麼都不知道。據說山縣有朋為此還狠狠的發誓，有朝一日，一定要給美國人一個報復。
旅順投降之後，第三軍的兵力就得以被解放出來，並用於奉天方向的作戰。在得到了新的兵力的增援，裝備上了防毒面具，（普通的日軍還不知道俄軍上次使用的毒氣是來自於美國的消息，事實上，除了高層有限的幾個人之外，這件事情就沒人知道了。原因很簡單――這樣的事情要是讓士兵們知道了，會很傷士氣的。）擁有了更多的火炮和機槍的日軍士氣大振，連續發動攻擊，打得俄軍節節敗退。陸地戰線上，俄軍已經原來越支撐不住了。
這時候，俄國後勤補給方面的弱點也暴露無遺。這個弱點甚至還不僅僅是絕對運力的不足，還包括後勤組織的混亂。前線極度的缺乏彈藥，但是從後方通過修了一大半的西伯利亞鐵路運過來的卻往往是些不知道是什麼玩意兒的東西，比如說，一整車皮的耶穌基督像，一整車廂的聖經什麼的。當然，這還不是最坑的，最坑的還是太平洋第二艦隊，也就是原本的波羅的海艦隊和黑海艦隊。他們因為在路過北海的時候，將一條英國漁船不知怎麼的就識別成了日本軍艦，然後一頓炮火給打沉了。結果給了英國人藉口，英國人不但不允許他們使用蘇伊士運河，從而迫使他們不得不繞過好望角趕赴亞洲，還向沿途的各個中立國施加壓力，要求它們不要向俄國艦隊提供可用於修整的港口以及燃煤。
俄羅斯地大物博，石油儲量更是大得驚人，然而在當時，俄國的石油並沒有完全的開發出來，同時缺乏大型耐壓容器生產技術，也使得俄國即使生產了原油，也缺乏煉油能力。所以為了便於補給，他們的船還是在使用煤炭的。
為了能有繞過整個非洲的航程，俄國人不得不在停靠法國港口的時候，儘可能的給自己的軍艦裝上更多的煤炭，結果不但煤倉里裝滿了煤炭，就連甲板上，甚至水兵們住宿的房間裡都塞滿了煤炭。
波羅的海艦隊從來沒考慮過自己會在熱帶的海洋上航行，所以他們的軍裝，即使是夏裝，相對於其他的國家，也都是加厚了的春秋裝。而他們出發的時候，因為天氣還冷，根本就沒帶上夏裝，帶的都是近乎冬裝的春秋裝。就這樣，等艦隊到了非洲附近的時候，所有的水兵都熱得不行，只好玩起了天體營。士兵可以這樣，但是軍官們卻還是要體面的，結果，隨行的那條醫院船上面每天都滿是因為中暑而被送過來治療的軍官。
艦隊繞過了好望角，到達了現在海盜出沒的索馬利亞海域的時候，終於等到了穿過蘇伊士運河給他們送衣服的運輸船，然後死要面子活受罪的軍官們滿懷希望的打開了新軍服的包裝，然後驚訝的發現――後勤部門的傻瓜給他們不遠萬里的送來了加厚的冬裝！
老實說，俄軍出現了這樣的後勤問題，其實也很正常，這一來是因為俄國人本來就缺錢，缺錢的國家，軍隊後勤好的不多。其次就是因為俄軍的腐敗。在任何一個部門機構當中，後勤總是也個很有油水可以撈的地方。由於俄軍的腐敗，導致後勤部門都落入了那些有關係的，想撈油水的人手中。這些人撈錢的技術都還不錯，但是做正事的能力就真的很成問題了。
就這樣，這支艦隊繞過了大半個地球，走了好幾個月，再將所有的水手都累垮了之後，終於開到了東方。然後像歷史上一樣，在對馬海峽，被以逸待勞的聯合艦隊打了個全軍覆沒。
……
「俄國和日本簽訂了停戰協議。」葛萊史東對史高治說，「和您估計的一樣，日本人勝利了。不過俄國人並沒有賠償哪怕一個盧布給日本。戰爭雖然是日本人贏了，但是他們的財政一點都沒有好轉。就目前的情況看，為了善後的工作，日本政府可能還需要再借一筆外債。至少在借債還債的循環還沒有結束之前，日本人是無論如何也不敢不履行和我們的協議的了。」
「朝.鮮半島上的礦山開發得怎麼樣了？」史高治問道。
「我們的精確勘探已經有結果了，發現了好幾個不錯的鎢礦和鉬礦。開採準備工作也在進行了，大約明年，我們就可以開始開採這些礦了。爸爸，我覺得這一仗真有意思。」葛萊史東回答說。
「哦？你有什麼想法？」史高治問道。
「日本人冒著巨大的風險打了這一仗，付出了巨大的代價才獲得了勝利，但是戰爭勝利的紅利卻沒吃到什麼。相反，倒是沒有參戰的吃到了最多的戰爭紅利。雖然說，從長遠上看，獲得了對朝.鮮的徹底的控制，以及旅順軍港何在整個滿洲優勢地位，從長遠來看，肯定還是有得賺的，但至少從短期來說，這個勝利沒為他們賺到什麼東西。不過過幾年日本人緩過勁來了，怕是不會就這樣眼巴巴的看著我們占便宜。」
「幾年後？」史高治笑了，「幾年後自然會有幾年後的麻煩的。而且，如果他們真的要背信棄義的找我們的麻煩，那不是正好能借著機會讓我們的政府強化海軍嗎？好了，日本這邊只是小買賣而已，真正的大買賣就快要開始了。」